El funcionamiento de un ALTER TABLE es sencillo:
1- MySQL bloquea la tabla que se desea modificar.
2- Crea una nueva tabla vacia con la nueva estructura.
3- Copia los datos de la antigua a la nueva.
4- Borra la antigua.
5- Renombra la nueva tabla con el nombre original.
Esto en tablas pequeñas puede ser un proceso de segundos o minutos. En tablas muy grandes, podemos estar hablando de horas. Horas en las cuales las consultas a dicha tabla estarán bloqueadas y las conexiones y peticiones se encolarán. Por lo tanto, hacer un ALTER TABLE en producción puede tener consecuencias bastante desastrosas.
Si tenemos replicación master-slave, podemos hacer el ALTER TABLE por fases. Primero lo hacemos en el esclavo. Cuando termine, promocionamos el esclavo a maestro y el maestro a esclavo. Y vuelta a lanzar el ALTER TABLE en el antiguo maestro (ahora esclavo).
¿Y si no tenemos …
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